يرأس المجلس التنفيذي النائب العام ويضم جميع رؤساء النيابات الجزئية والكلية ونيابة مكافحة الفساد وجرائم الأموال ومدير عام النيابة ورئيس ديوان النائب العام ويعقد المجلس التنفيذي اجتماعاته بشكل شهري برئاسة النائب العام لمناقشة القضايا والمواضيع والمهام التالية :-

1- متابعة تنفيذ بنود الخطة التشغيلية لكل نيابة من النيابات وكذلك الادارات والوحدات  .

2- تطوير العلاقة مع القضاء ووزارة الداخلية وكافة الشركاء من مؤسسات المجتمع المحلي .

3- تحسين جودة الخدمة المقدمة للجمهور والمحامين والمؤسسات .

4- مناقشة التعليمات القضائية الفنية والإجرائية وسبل تطبيقها .

5- مناقشة النظام الجديد لسياسة الباب المفتوح ورد المظالم.

6- متابعة الالتزام بالتعليمات الإدارية لضمان ضبط الموظفين وحسن سير العمل

7- مناقشة التحديات والمعوقات التي تواجه النيابات في تنفيذ أعمالها ومهامها والخروج بالتوصيات المناسبة .